Wir stellen hier in sehr komprimierter Weise die Elemente der genetischen Informationsübertragung dar. Dieser Beitrag basiert auf verschiedenen – wesentlich ausführlicheren – Artikeln der deutschen Wikipedia und The Sequence Onotolgy.
1. Gen¶
Ein Gen ist ein Abschnitt auf der DNA.
Die Gene in der DNA enthalten die Information zur Herstellung der RNA (Ribonukleinsäuren).
Protein-codierende Gene codieren mRNA (messenger RNA). Die mRNA enthält die Information zum Bau von Proteinen.
Die Abfolge der Basen bestimmt die Abfolge der Aminosäuren des Proteins. Jeweils drei nebeneinander liegende Nukleotide bilden ein Codon, mit dessen Hilfe sich eine spezifische Aminosäure, die in ein Protein eingebaut werden soll, eindeutig bestimmen lässt.
1.1. Genexpression¶
Die Expression eines Gens beschreibt dessen Aktivität zur Bildung des von dem Gen kodierten Genprodukts (insbesondere Proteine oder RNA-Moleküle).
2. DNA (Desoxyribonukleinsäure)¶
Eine doppelstrangige Verkettung von 4 möglichen Nukleotiden.
Die DNA befindet sich meist im Zellkern als Chromosomen (nukleäre DNA = nDNA) und trägt bei fast allen Lebewesen die Erbinformation. Ein geringer Teil der DNA befindet sich in den Mitochondrien (Zellkraftwerke) als mitochondriale DNA (mtDNA).
Modell einer DNA. CC BY-SA 3.0
3. RNA (Ribonukleinsäure)¶
Eine meist einzelstrangige Verkettung von 5 möglichen Nukleotid-Arten.
RNA ist bei bestimmten Viren der Träger der Erbinformation. Es gibt RNA, die (Erb)Informationen weitergibt (codierende RNA) und solche, die dies nicht tut.
allein in 2017 und 2018 wurden jährlich je 2000 neue RNA-Formen entdeckt. PubMed findet in den Jahren 2014 bis 2018 zum Suchbegriff RNA rund 250.000 neu erschienene wissenschaftliche Artikel. Zum Vergleich: zum Stichwort ADHD (englisch für ADHS waren es knapp 11.500).
3.1. Codierende RNA (mRNA)¶
mRNA kopiert die in einem Gen liegende Information, vermittelt sie an das Ribosom, wo mittels dieser Information die Proteinbiosynthese stattfindet.
Formen:
- NSD transcript
- capped mRNA
- consensus mRNA
- edited mRNA
- exemplar mRNA
-
mRNA with frameshift
- monocistronic mRNA
- polyadenylated mRNA
- polycistronic mRNA
- recoded mRNA
- trans spliced mRNA
3.2. Nicht-codierende RNA (ncRNA)¶
Es gibt viele Arten nicht-codierender RNA. Sie können die Expression von Genen verändern.
Formen nicht-codierender RNA:
- asRNA (antisense-RNA)
- reguliert die Genexpression
- wird aus dem kodierenden DNA-Strang und nicht aus dem Matrizen-DNA-Strang transkribiert. Ist daher komplementär zu mRNA.
- circRNA (zirkuläre RNA)
- bindet an miRNA. Ist dadurch an der an der Regulation zellulärer Prozesse beteiligt, wie z.B. Proliferation oder Apoptose (Zelltod)
- class I RNA
- class II RNA
- enhancerRNA
- könnte regulatorische Funktion haben
- guide RNA
- hnRNA (heterogene Kern-RNA, heterogeneous nuclear RNA)/ prä-mRNA (pre-mRNA, precursor mRNA)
- lncRNA (long non-coding RNA)
- länger als 200 Nukleotide
-
miRNAs (microRNAs)
- eng verwandt mit siRNAs
- regulieren zelluläre Prozesse wie z.B. Proliferation und Zelltod mit
- piRNA (Piwi-interacting RNA)
- 26–31 Nukleotide lang
- bilden Komplexe mit PIWI-Proteinen, die am epigenetischen und posttranskriptionellen Silencing in Keimzellen beteiligt sind
- Riboswitches
- dienen der Genregulation
- aktivierend oder reprimierend
- Ribozyme
- katalytisch aktive RNA-Moleküle
- katalysieren chemische Reaktionen, so wie Enzyme
- rRNA (ribosomale RNA)
- trägt keine genetische Information (wie tRNA)
- ist am Aufbau des Ribosoms beteiligt
- ist bei Knüpfung der Peptidbindung auch katalytisch aktiv
- rRNA cleavage RNA
- rasiRNA (repeat associated small interfering RNA)
- RNase MRP RNA
- essentiell für die katalytische Aktivität von RNase MRP.
RNase MRP ist ein enzymatisch aktives Ribonukleoprotein, das in den Mitochondrien bei der Initiierung der mitochondrialen DNA-Replikation mitwirkt und im Zellkern an der Vorläufer-rRNA-Prozessierung beteiligt ist, wo es den internen transkribierten Spacer 1 zwischen 18S- und 5,8S-rRNAs spleisst.
- RNase P RNA
- scRNA (small cytoplasmic RNA)
- scaRNA (small cajal body-specific RNA)
- finden sich in den Cajal Bodies
- Unterklasse der snoRNA
- steuern die Modifikation (Methylierung und Pseudouridylierung) der RNA-Polymerase-II-transkribierten spliceosomalen RNAs U1, U2, U4, U5 und U12.
- scaRNA1 (small cajal body-specific RNA 1, ACA35)
- scheint an der Pseudouridylierung von U2-spliceosomaler RNA am Rest U89 beteiligt zu sein
- shRNA
- siRNA (small interfering RNA)
- entsteht bei einem als als RNAi (RNA Interference) bezeichneten Signalweg der Zelle
Dabei wird dsRNA (doppelsträngige RNA, double-stranded RNA) durch das Enzym Dicer in viele kleiner siRNAs aufgeteilt und in RISC (RNA-induced silencing complex, ein Enzymkomplex) eingebaut. Mittels der enthaltenen RNA-Fragmente bindet RISC an DNA (z.B. an Genbereiche) oder an mRNA und kann diese damit „abschalten“.
- siRNAs sind an verschiedenen Zellvorgängen und Krankheiten beteiligt.
- snRNA (small nuclear-RNA)
- finden sich im Zellkern
- verantwortlich für das Spleißen der hnRNA am Spleißosom.
- snoRNA (small nucleolar-RNA)
- finden sich im Nukleolus
- eng verwandt mit scaRNAs
- small regulatory ncRNA
- SRP RNA
- tRNA (Transfer-RNA)
- codiert keine genetische Information
- Hilfsmolekül bei der Proteinbiosynthese
- nimmt einzelne Aminosäure aus dem Cytoplasma auf und transportiert sie zum Ribosom
- tRNA wird durch ein bestimmtes RNA-Gen codiert
- tasiRNA
- telomerase RNA
- telomeric transcript
- three prime overlapping ncRNA
- vault RNA
- Y RNA
4. Nukleotide¶
Nukleotide bestehen jeweils aus einer Base, einem Zucker und einem Phosphat:
- Base (fünf mögliche Basen)
- Adenin (A)
- Guanin (G)
- Cytosin (C)
- Thymin (T)
- Uracil (U) (in DNA stattdessen nur Thymin)
- Zucker
- Ribose (D-Ribofuranose) oder
- Desoxyribose (2-Desoxy-D-ribofuranose)
- Phosphat
- mindestens eine Phosphatgruppe
5. Proteine (Eiweiße)¶
Proteine sind erforderlich für die biologische Entwicklung eines Lebewesens und den Zellstoffwechsel.
Menschliche Proteine können aus 21 verschiedenen α-Aminosäuren entstehen. Die α-Aminosäuren verketten sich untereinander durch Peptidbindungen zu einem Polymer (Polypeptide). Diese Polypeptide falten sich im wässrigen Milieu zum nativen Protein auf.
Die Biosynthese von Proteinen findet in allen Zellen an den Ribosomen anhand von mRNA statt, die als genetische Information den Bauplan von Proteinen übermitteln.
Die Abfolge der Basen der mRNA codiert in Tripletts (Codons) die Sequenz der (proteinogenen) Aminosäure. Nach der Translation können die Seitenketten von manchen im Protein eingebauten Aminosäuren noch verändert werden.
Eine Studie fand eine Korrelation von ADHS mit den Proteinen Lysosomal Pro-X carboxypeptidase und Alpha-2-antiplasmin im Blutplasma.
6. Aminosäuren (Aminocarbonsäuren)¶
Aminosäuren sind chemische Verbindungen mit einer Aminogruppe (enthält Stickstoff) und einer Carbonsäuregruppe (enthält Kohlenstoff), die in allen Lebewesen vorkommen.
Aminosäuren sind die Bausteine von Proteinen (Eiweiß).
Sie dienen primär dem Aufbau von Körpergewebe und sind die Endstufen des Abbaus von Eiweiß.
Essentielle Aminosäuren können von einem Organismus nicht selbst hergestellt werden und müssen deshalb über die Nahrung aufgenommen werden.
Aminosäuren lassen sich nach verschiedenen Kategorien unterscheiden:
6.1. Arten von Aminosäuren¶
6.1.1. nach Aufbau¶
- Aminosäuren nach Aufbau
- α-Aminosäuren (2-Aminocarbonsäuren, z.B. Glycin)
- β-Aminosäuren (3-Aminocarbonsäuren, z.B. β-Alanin)
- γ-Aminosäuren (4-Aminocarbonsäuren, z.B. γ-Aminobuttersäure = GABA)
6.1.2. Aminosäuren nach Funktion¶
- Proteinogenität
Proteinogenität bedeutet, dass die Aminosäure als Baustein von Proteinen dient
- Proteinogene Aminosäuren
- α-Aminosäuren, die Bausteine der Proteine sind, beim Menschen 21 verschiedene
Name / Häufigkeit in Proteinen / essentiell:
- Alanin (9,0 %)
- Arginin (4,7 %) teilessentiell
- Asparagin (4,4 %)
- Asparaginsäure (5,5 %)
- Cystein (2,8 %) für Kinder und Schwangere essentiell
- Glutamin (3,9 %)
- Glutaminsäure (6,2 %)
- Glycin (7,5 %)
- Histidin (2,1 %) teilessentiell
- Isoleucin (4,6 %) essentiell
- Leucin (7,5 %) essentiell
- Lysin (7,0 %) essentiell
- Methionin (1,7 %) essentiell
- Phenylalanin (3,5 %) essentiell
- Prolin (4,6 %)
- Pyrrolysin (nichtkanonisch, nur bei Bakterien)
- Selenocystein (nichtkanonisch)
- Serin (7,1 %)
- Threonin (6,0 %) essentiell
- Tryptophan (1,1 %) essentiell
- Tyrosin (3,5 %) für Kinder und Schwangere essentiell
- unbekannte Aminosäure (unklar, ob Aminosäure)
- Valin (6,9 %) essentiell
- nichtproteinogene Aminosäuren
- natürlich vorkommende (= biogene / organogene) Aminosäuren
- mehr als 400 nichtproteinogene Aminosäuren mit biologischen Funktionen
- D-Aminosäuren (selten) sind spezielle Untergruppe
- synthetisch erzeugte / theoretisch mögliche Aminosäuren
-
Neurotransmitter
- einige Aminosäuren fungieren als Neurotransmitter
- ebenso einige Abbauprodukte von Aminosäuren
- Hormone
- Gewebsmediatoren
6.1.3. Aminosäuren nach Entstehung¶
- natürlich vorkommend (= biogen / organogen)
- synthetisch erzeugt
